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诊断HP的方法大致可分为3类：①直接从胃粘膜组织中检查HP，包括细菌培养、组织涂片或切片染色镜检；②用尿素酶试验、呼吸试验、胃液尿素氮检测等方法测定胃内尿素酶的活性；③血清学检查抗HP抗体。
细菌培养是诊断HP感染最可靠的方法，是验证其他诊断性试验的金标准，但需要一定的条件和技术。组织切片染色检查HP以WarthinStarry染色和改良Giemsa染色的效果为好，细菌清晰易辨认。取胃窦粘膜作组织涂片，再作革兰氏染色检查HP是一种快速简便的方法。组织尿素酶检测也是一种简便、快速的诊断方法。血清学检测采用酶联免疫吸附测定（ELISA）法，测定血清中抗HP抗体，其敏感性和特异性都比较高，可应用于流行病学调查。
近年来随着分子生物学技术的迅速发展，特别是聚合酶链反应（PCR）技术的应用，能特异地检出活检组织中的HP，该技术是基于天然DNA复制的原理而设计的一种体外DNA扩增方法。该测定方法最大特点是特异性强和灵敏度高。目前应用PCR检测HP的扩增物有以下两类：①扩增HP尿素酶基因某个片段；②扩增HP16SrRNA基因片段。随着PCR技术日臻完善，其应用前景为：①作为非侵入性方法，诊断HP感染；②作为流行病学调查工具，确定细菌感染的来源及传播途径；③研究HP遗传学特性，进行细菌致病因子基因的分裂、克隆，然后确定与HP毒素决定因子表达有关的基因，如尿素酶基因、细胞毒素基因和粘着素基因，有助于更深入地了解HP的致病机制。
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